La flûte traversière moderne naît en 1847 des travaux du Munichois Theobald Böhm. Lassé du manque de justesse de l'instrument, il se lance dans l'étude des lois acoustiques et calcule la distance exacte qui doit séparer les trous. Il met ensuite au point un système de clés et de leviers qui permettent de boucher les quatorze trous de la flûte avec seulement neuf doigts, le pouce de la main droite soutenant l'instrument. Dans ses travaux, Böhm recommande également l'utilisation de flûtes en métal au lieu de flûtes en bois.
Le type de flûte traversière le plus répandu de nos jours est une flûte soprano en ut. Il existe également une flûte alto en sol accordée une quarte en dessous, ainsi qu'une petite flûte en ut2 qui s'appelle le piccolo.
